對于袋裝或瓶裝食品，微波設備憑借其穿透力，能穿透包裝及包裝內的食品、藥品干燥殺菌，而包裝材料如玻璃、紙張、陶瓷等，因其不吸收微波，所以不會發熱，這樣產品更衛生，避免二次污染。不過需要特別注意的是，由于金屬、鋁箔反射微波而不能被穿透，顧包裝不能采用金屬材料或者含有金屬成分。其次，用微波設備處理袋裝或瓶裝藥、食品時，因包裝內的食品、藥品會發熱，造成氣壓升高，如果完全密封且氣壓過大，氣壓可能會沖破包裝。解決的方法有：

 

1、先用微波殺菌然后迅速密封或加蓋。

2、密封后放置要壓力容器內再用微波殺菌。

3、真空包裝后再用微波殺菌。

 

   在袋裝食品的殺菌保鮮問題上，微波的穿透性、不破壞營養成分和低溫殺菌等點，呈現出明顯的優越。上?？诟Ｊ称房倧S選用2450兆赫微波，對袋包熏魚、叉燒、麻雀、肉松等熟食品的殺菌處理，細菌殺滅率在95%以上。

 

   實踐表明微波殺菌可廣泛用于各種熟食品（魚、肉、豆制品、醬菜等）和飲料。近年來魚片干的市場需求不斷增長，部分產品還遠銷國外，但長期以來均因缺乏有效殺菌手段而出現產品霉變現象，采用2450兆赫10千瓦微波處理設備，不僅具有加熱干燥功能而且有殺菌滅酶效果，現已廣泛應用于魚片烘干和熟化烘烤，節能效果50%以上，魚片酥軟可口。